La Temporada se compone de dos (2) torneos, Apertura y Clausura.
El Apertura se compone de siete (7) grupos de entre cuatro (4) y seis (6) equipos respectivamente, agrupados por zona geográfica. Se jugará en dos (2) vueltas en formato de liga. Los dos (2) primeros de cada grupo, clasificarán al Torneo de Promoción y Permanencia de Segunda División.
El Clausura se compone de cinco (5) grupos de entre cuatro (4) y seis (6) equipos respectivamente, agrupados por zona geográfica. Se jugará en dos (2) vueltas en formato de liga. El líder de cada grupo será el campeón de Tercera División, independientemente.
Observaciones
Muchos de los resultados son recolectados desde www.rsssf.com, ahev.com, Libro del Fútbol Profesional de Venezuela 1986-96 de Efrén Peña y Graciano Cruz S., Diario Meridiano, Diario Líder, ESPN, Diario Últimas Noticias y Diario El Nacional, revista Élite, revisados y confirmados mediante una exhaustiva investigación; los escudos son recolectados por Armando García.
Créditos de la información:
Los mejores equipos del Torneo Apertura 2012 clasifican al Torneo de Promoción y Permanencia 2013 de Segunda División, el resto permanecen en Tercera División una Temporada más.
Tanto PDVSA Morichal y Inter-Maracaibo debieron clasificar al Torneo de Promoción y Permanencia, pero se retiraron, uno de los puestos fue ocupado por UA Alto Apure y el otro quedó vacante.
Unión Atlético Aragua cede su cupo a Unión Lara.
Neptuno FC cede su cupo a Margarita FC.
Upata FC no pudo participar por problemas económicos. Su puesto lo ocupó Escuela Libertad Socialista.
Boconoíto FC pasa a llamarse Bejuma CF.
Estudiantes de Guárico, descendido, cedió su cupo a Escuela Seguridad Ciudadana.
Academia Emeritense, descendido, cedió su cupo a Lanceros de Zamora.
Real Bolívar COL desiste en participar esta temporada, su cupo lo tomó Internacional de Maracaibo.